应该是从遥远的宇宙彼方K隆星来侵略()地球的KERORO小队，在剧()场版中却将地球从可怕的危机中拯救出来……这一次，KERORO军曹的面前出现了最新！最()恶！最强的敌人！！　　故事讲述冬树与KERORO小队一起去印加帝国的马丘比()丘()足迹参()观，喜欢神()秘事物的冬树当然是大为高兴，可是KERORO的脑袋里()面装满了()要侵略地球的事情。他()们在那里因为迷路而发现了遗迹，后来因为突发状况而不得不从那里逃出。但在那时，冬树一瞬间看见了一位伫立在迷途中()的少女。抱着对少女的不解之迷()，冬树与KERORO回到了东京。不过这时，最强的敌人出现在了他们面前。样子和KERORO一()模一样，但与KERORO不同天空対決戦ｔテンクウたい的是，他()是要迅速且透彻地策划侵略地球的黑暗KERORO。他带领着部下CIBABA、DORURU、MIRURU一起在世界各国开始了侵略行动。而迎击这一()切的KERORO小队的命运是？……