西暦2062年。労働()力の大幅な()自動化プロジェクトの失()敗後、その中核となる人工知能アルテミスが人類との戦いを選んだ()末、荒廃した二十年後の地球。　　とある基地の地下研究施設で、ひとりの少女、エンプレスが目覚める。彼()女は人類の守護者３人の生き残りのうち()のひとりであった。　()　しかし彼()女には以前の記憶がない。そんなエンプレスに平和構築()軍の大佐は告げる。　　エンプレスには、現在、アルテミスが建設中の月と地球を結ぶ軌道エレベ()ーターを完成前に破壊する使命があることを。　　完成()すれば月で大量生産中の()巨大機械軍が大挙して地()球へやってくるからだ()。　　だが、その行く手を仲間であっ()たはずのデッドマスタ()ーやストレン()グス、アルテミスの手先である無人軍隊やカルト集団＜教育機関＞のスマイリーらが()阻もうとする。　　さまざまな思惑が交差する中、大佐ら()と軌()道エレベーターを目指して進んでいくエンプレス。その先で待ち受けるものとは……。